KEGG
KEGG
Подписчиков: 0, рейтинг: 0
KEGG (ang. Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) – zbiór dostępnych w Internecie bioinformatycznych baz danych, które zawierają informacje nt. genomów i genów, szlaków metabolicznych (reakcji chemicznych i enzymów) i metabolitów. Znajdują się one w osobnych sieciach: białkowej, genetycznej i biochemicznej.
Informacje podstawowe
KEGG została zapoczątkowana przez japoński program ludzkiego genomu (Laboratorium Kanehisa w Instytucie Badań Chemicznych) w 1995 r.. Jej twórcy uważają KEGG za komputerowe odzwierciedlenie układu biologicznego. Baza danych KEGG ma wiele zastosowań: modelowanie, symulacja, przeglądanie i pobieranie danych.
Bazy danych
KEGG zawiera w sobie 5 baz danych:
- KEGG Atlas
- KEGG BRITE
- KEGG Genes
- KEGG Ligand – zawiera informacje o związkach i reakcjach chemicznych, które biorą udział w zachodzących w komórce procesach; składa się z następujących części:
- Compound
- Drug
- Glycan
- Reaction
- RPAIR (Reactant pair alignments)
- Enzyme
- KEGG Pathway – zawiera informacje na temat sieci komórkowych interakcji molekularnych i ich wariantów charakterystycznych dla konkretnych organizmów; jej części to:
- Metabolism
- Genetic Information Processing
- Environmental Information Processing
- Cellular Processes
- Human Diseases
- Drug development